A história começa numa cidade futurista chamada Romdo, construída para a proteção dos cidadãos após o apocalipse ambiental global. Nesta utopia, humanos e androides coexistem uns com os outros, num ambiente de total controle. Uma série de assassinatos cometidos por robôs descontrolados infectados por um vírus chamado Cogito começa a estragar a delicada ordem social. Por trás dos panos, o governo vem conduzindo experimentos secretos com uma misteriosa forma de vida humanoide chamada Proxy, a qual supostamente teria a chave para a sobrevivência da humanidade.
Lain é uma jovem adolescente solitária que desenvolve um fascínio pela informática e pelo Wired após a morte de uma das suas colegas de escola. Um e-mail, enviado por esta após a sua morte, explica que o seu corpo deixou de viver e que ela vive agora no wired. O anime em si é bastante complexo, mas muito interessante, pois prende a atenção.
A história segue os irmãos Kirihara que desde muito jovens foram encarcerados em uma instalação científica segura devido aos seus poderes sobrenaturais, tendo escapado após a barreira que os impedia de mau funcionamento. A história também segue os irmãos Kuroki que estão tentando perseguir os irmãos Kirihara.
evido aos seus poderes sobrenaturais, tendo escapado após a barreira que os impedia de mau funcionamento. A história também segue os irmãos Kuroki que estão tentando perseguir os irmãos Kirihara.
