
O Departamento de Segurança Interna recruta um gênio e sua equipe de prodígios para proteger a nação contra uma nova e sofisticada geração de terroristas.

Um hacker começa a divulgar os segredos dos alunos para toda a escola, e Sofia, uma menina observadora e solitária, quer descobrir quem está por trás disso.

Elliot é um jovem programador que sofre de uma desordem que o torna anti-social. Acreditando que a única forma de se conectar com as pessoas é hackeando suas vidas, ele alia seu conhecimento ao fato de trabalhar em uma empresa de segurança online para proteger aqueles que ele ama daqueles que tentam, de alguma forma, prejudicá-los. Suas atividades chamam a atenção de Mr. Robot, um misterioso anarquista que convida Elliot a fazer parte de uma organização que atua na ilegalidade com o objetivo de derrubar as corporações americanas.

Em Den City onde a última rede se desenvolveu, as pessoas estavam duelando dia e noite no mundo VR chamado LINK VRAINS gerenciado pela SOL Technology Inc. O personagem principal, Yusaku Fujiki é um estudante de escola secundária silencioso com uma ótima visão. Ele tem duelado, transformando-se em seu avatar Playmaker, para combater os The Knights of Hanoi que planejam destruir LINK VRAINS.
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