Rei Kiriyama é um rapaz de 17 anos de idade, que recentemente começou a viver sozinho, financiado pelo seu salário como um jogador de Shogi profissional. Apesar de sua independência, no entanto, ele ainda está amadurecendo emocionalmente, e seus problemas continuam a assombrá-lo em sua vida diária. Seu relacionamento com sua família adotiva é tensa, e ele tem dificuldades de interagir com seus colegas do ensino médio. Enquanto isso, sua carreira profissional entrou em uma recessão. Sobrecarregado com as expectativas pesadas colocadas sobre ele como o quinto para se tornar pro no ensino médio, suas vitórias e derrotas são flutuantes como seu registro e progressão para os ranks começarem a estagnar. Esta é a história de triunfos de Rei e fracassos, relacionamentos novos e antigos, e seu crescimento como pessoa.
Uma mulher de 30 anos, desiludida com coisas que aconteceram na sua vida, decide abandonar seu emprego e virar uma NEET (pessoal que vive trancado em casa na frente do PC), abandonando o mundo real pelo mundo do MMORPG, aonde cria um char masculino. A história acompanha a interação dela com outros players com quem vai formando uma party. Coincidentemente, ela acaba conhecendo todos na vida real, sem perceber quem são.
O governo japonês foi resgatado de um colapso financeiro. Entretanto, para os cidadãos, a vida não melhorou e o desemprego, crime, suicídio e desespero aumentam cada vez mais. Kimimaro, criado pela avó materna após o desaparecimento de seu pai e a morte de sua mãe, é bolsista cujo único sonho é evitar tudo isso e viver uma vida estável. Um dia, ele encontra um homem que lhe oferece uma grande quantia de dinheiro, se, ele concordar em pagar de volta. A partir de então seu destino é radicalmente alterado como ele é arrastado para um mundo misterioso conhecido como "Distrito Financeiro".
Após a morte, os humanos são mandados para a reencarnação ou para o vácuo. Mas alguns acabam indo parar no Quindecim, um bar onde um bartender misterioso de cabelos brancos, chamado Decim, trabalha. Todos que vão parar nesse lugar são desafiados a jogar vários tipos de jogos mortais, onde suas verdadeiras personalidades são reveladas, sendo que no final, é decidido pelo árbitro se os participantes irão para a reencarnação ou para o vácuo.
Um homem decide não deslogar quando um VRMMORPG antigo é fechado e como consequência ele é transportado para o jogo. Com apenas ele ali e sem uma família para se preocupar ele começa a tentar dominar o mundo do jogo, aonde os NPCs estão mudando pouco a pouco e começando a sentir emoções humanas.
A história gira em torno do garoto Sora e da garota Shiro, dois irmãos que carregam a reputação de serem NEETs brilhantes. Os dois hikikomoris são gamers conhecidos por toda a internet pelos seus feitos brilhantes, enquanto encaram a vida real apenas como um jogo chato e defeituoso. Bem, um dia eles são convidados por um garoto chamado de Deus para uma espécie de mundo alternativo onde tudo é decidido na base dos jogos: aqueles que vencem recebem a propriedade de tudo e com isso a humanidade estará livre de guerras, mas próxima do colapso. Agora resta saber se Sora e Shiro serão capazes de vencer esse jogo também para evitar que o mundo acabe.
